Если юрлицо заплатило госпошлину за сотрудника (например, за загранпаспорт для командировки), но перечислило больше, чем требовалось, то за переплатой должен обратиться работник от своего имени. В заявлении на возврат он должен указать свой счет, а не работодателя. Минфин объясняет это так: когда пошлину перечисляет за себя не сам плательщик и не его представитель, а кто-то другой, последний не вправе требовать вернуть ее.

Ведомство уже говорило об этом.

Документ: Письмо Минфина России от 25.05.2018 N 03-05-06-03/35693